Od prvega primera koronavirusne bolezni decembra 2019 se je pandemična bolezen razširila na milijone ljudi po vsem svetu.Ta globalna pandemija romanahud akutni respiratorni sindrom koronavirus 2 (SARS-CoV-2)je ena najbolj prepričljivih in zaskrbljujočih globalnih zdravstvenih kriz sodobnega časa, ki predstavlja veliko grožnjo svetu in vpliva na vse vidike človeškega življenja.[1]
Koronavirusi so enoverižni RNA virusi z ovojnico v pozitivnem smislu iz družine Coronaviridae, ki imajo širok spekter gostiteljev, kot so ljudje, netopirji, kamele in ptičje vrste, vključno z živino in domačimi živalmi, ki predstavljajo grožnjo javnemu zdravju. 1 Koronavirusi so razvrščeni v poddružino Orthocoronavirinae, ki je nadalje razdeljena na štiri rodove, ki temeljijo na razlikah v proteinskih zaporedjih: a-koronavirus, b-koronavirus, g-koronavirus in d-koronavirus.A-koronavirusi in b-koronavirusi okužijo samo sesalce, medtem ko g-koronavirusi in d-koronavirusi okužijo predvsem ptice, čeprav nekateri od njih lahko okužijo sesalce.HCoV-229E,
oV-OC43, HCoV-NL63, HCoV-HKU1, SARSCoV, MERS-CoV in SARS-CoV-2 je sedem koronavirusov, za katere je bilo ugotovljeno, da okužijo ljudi.Med njimi sta visoko patogena SARSCoV in MERS-CoV, ki sta se v človeški populaciji pojavila v letih 2002 in 2012.Medtem ko sevi človeškega koronavirusa (HCoV)-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43 ali HCoV-HKU1, ki krožijo v človeški populaciji, povzročajo le navaden prehlad,7 je hud akutni respiratorni sindrom koronavirus 2 (SARS-CoV2), povzročitelj COVID-19 je nov B-koronavirus, ki se je zgodaj pojavil konec leta 2019 in je povzročil uničujoče smrti.Primarni simptomi priCOVID 19so podobni tistim pri SARS-CoV in MERS-CoV: zvišana telesna temperatura, utrujenost, suh kašelj, bolečine v zgornjem delu prsnega koša, včasih driska in dispneja.Za razliko od preteklostiokužbe s koronavirusom (CoV)., hitro globalno širjenje, visoka stopnja prenosa, daljši čas inkubacije, več asimptomatskih okužb in resnost bolezni SARS-CoV-2 zahtevajo poglobljeno znanje o strategijah virusnega imunskega izogibanja.
Tako kot drugi človeški koronavirusi (SARS-CoV-2, MERS-CoV) ima tudi SARSCoV-2 enoverižni genom RNK s pozitivnim čutom, velik okoli 30 kb.Kot je prikazano na sliki 1, proteini virusne nukleokapside (N) povežejo genom v velik ribonukleoproteinski (RNP) kompleks, ki ga nato obdajo lipidi in virusni proteini S (konica), M (membrana) in E (ovojnica).50. konec genoma ima dva velika odprta bralna okvirja (ORF), ORF1a in ORF1b, ki kodirata polipeptida pp1a in pp1b, ki se proizvajata v 16 nestrukturnih proteinov (NSP), ki vključujejo vse vidike replikacije virusa z virusnima proteazama NSP3 in NSP5, ki skrivata papainu podobna proteazna domena oziroma 3C-podobna proteazna domena.9 Konec 30 genoma kodira strukturne proteine in pomožne proteine, od katerih je bilo dokazano, da so ORF3a, ORF6, ORF7a in ORF7b vpleteni virusni strukturni proteini pri tvorbi virusnih delcev, ORF3b in ORF6 pa delujeta kot antagonista interferona.Glede na trenutno opombo na podlagi podobnosti zaporedja z drugimi B-koronavirusi SARS-CoV-2 vključuje napovedi šestih dodatnih proteinov (3a, 6, 7a, 7b, 8 in 10).Vendar vsi ti ORF še niso bili eksperimentalno potrjeni in natančno število pomožnih genov SARS-CoV-2 je še vedno predmet spora.Zato še vedno ni jasno, kateri dodatni geni so dejansko izraženi s tem kompaktnim genomom [2].
Zelo občutljivi in specifični testi so ključnega pomena za prepoznavanje in obvladovanje bolnikov s COVID-19 ter izvajanje nadzornih ukrepov za omejitev izbruha.Molekularni testi na kraju samem (POC) lahko omogočijo zgodnejše odkrivanje in2 izolacijo potrjenih primerov SARS-CoV-2 v primerjavi z laboratorijskimi diagnostičnimi metodami, s čimer zmanjšajo prenos v gospodinjstvu in skupnosti.
[1]Klinični in operativni učinek hitrega odkrivanja SARS-CoV-2 na mestu oskrbe na urgentnem oddelku
[2] Bitka med gostiteljem in SARS-CoV-2: prirojena imunost in strategije izogibanja virusom
Čas objave: 25. maj 2022